我们都知道，普通的显微镜只能通过眼睛进行观察，而当我们在镜下找到一个目标位置后再去找另外一个目标时，第一个目标往往会因为移动样品之后很难再重新找到，这样就导致很多数据的丢失，特别是当我们需要对这些数据进行比较的时候，因为没有原始数据进行对比使我们很苦恼。显微成像系统的研发成功解决了广大研究者的苦恼问题，通过显微成像系统抓取到每次观察的样品图像，这样就能很好的保存第一手的原始数据，不仅可以作为实验的数据进行对比，还能永久的保存下来作为一份有价值的参考数据。

但是，使用显微成像系统时，要想取得好的显微成像效果，那则需要注意以下影响显微成像质量好坏的九大因素：
1、使用显微镜时，被检物体做的是否标准很重要。如：切片厚度是否太厚，盖玻片是否符合国标等。
2、显微镜物镜按档次可分为约6-8个档，最常用的为平场消色差物镜。如镜头档次太低，则成像质量会下降。因此，建议选择平场以上档次物镜。
3、聚光镜孔径光栏，尽量和物镜的数值孔径相符，才能得到最佳的图像分辨率。
4、调焦系统作为机械部分的重要部件，调焦精度也非常重要。对于生物学初学者或刚接触显微镜的操作者，熟练的使用调焦系统，能快速找到图像并聚焦，提高工作效率。
5、载物台在观察切片时，常做X,Y的移动。如：双层的机械移动平台，精度和稳定性较好，能在观察显微图像时提供好的成像质量。
6、非球面集光镜能提供非常均匀的照明光线，所观察到的显微图像衬度极佳。
7、视场光栏应根据观察不同的被检物体和物镜倍率开启到合适的位置，如开得过大或过小显微图像的视场亮度会受到影响。